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這個世界有一種名為寶可夢的生物，在成都地區，一位名叫阿金的十歲少年今天要領取他的寶可夢踏上旅行，這天驚奇的很，早在博士研究所的外面，他看到了一位紅色頭髮的少年，正趴在究所的外面，偷偷的往裡看。金走到他的面前，他已經觀察這位少年好多天了，知道這位少年正是火箭隊，首領板木的兒子小銀。而他正準備盜取御三家，御三家就是每個地區，在那裡，你成長的孩子十歲領取之後，踏上旅途的第一隻寶可夢。經開口說“：我知道你想到取域三家，你是火箭隊的首領板木的兒子，我想跟你一起加入火箭隊，我在這裡不受待見。快點吧，等會兒。另一位女生克麗斯塔兒，要來了。我們得快一點。” 銀在離開火箭隊後，一直沒有朋友，直到遇到了阿金，小銀，同意了他。他們倆趁博士不在，翻入了研究所，阿金阿金是可以明目張膽的拿的，於是負責打掩護，於是他倆拿走了兩隻寶可夢，小銀拿走了小鋸鱷，阿金拿走了火球鼠，他們倆拿到寶可夢後立刻翻出去逃走了，阿金在和小銀拿走御三家之後立刻跟小銀回到了火箭隊，製作研究所的博士是空木博士，他發現後立刻把僅剩的菊草葉給了克里麗斯塔兒，一路上雖有很多追兵，但他們還是到達了火箭隊，這一路上小鋸鱷和火球 鼠也進化成了藍鱷和火炎鼠。
眼看就要跑走了，又一位追兵來了，他用精靈球放出了一個巨大的寶可夢，精靈球是可以收服寶可夢的工具，可以把寶可夢放在裡面。這一路上，追兵派出的寶可夢都是阿金認出來的，而這個巨大的寶可夢阿金沒認出來，他們拿出來了，從空木博士研究所裡偷來的寶可夢圖鑑。寶可夢圖鑑是可以認出世界上所有的寶可夢，還具有調查寶可夢棲息地的工具，眼前這個巨大的寶可夢是尼多後，尼多娜的進化型，屬於二階進化。毒和地面屬性的鑽錐寶可夢，小銀讓藍鱷使用水槍效果拔群尼多後被幹掉了。尼多後被幹掉後，小阿金和小銀成功跑走了。他們倆拿出身上的錢，購買了精靈球。準備去收服寶可夢，他們倆走進了草叢這時，一隻尼多力諾跳了出來，尼多利諾尼多朗的進化型，最終進化形為尼多王。阿金看到後二話沒說，命令火炎鼠使出火花，受到攻擊後扔出精靈球，成功收服了尼多力諾。而小銀那邊也捕捉到了一隻鬼斯通。打敗眾多訓練家之後，來到了桔梗市，此時，他倆已經成為了通緝犯，但是桔梗市還沒有收到訊息，阿金走進了道館，道館是每個城市都有的，用來考驗訓練家實力的地方，戰勝道館主之後會獲得徽章。集齊地區所有徽章之後，就可以參加聯盟大會。小銀和阿金輕鬆戰勝了道館主。這時，克麗斯塔兒帶著已經進化成月桂葉的菊草葉來了，阿金自告奮勇準備對決 對戰開始了，克麗斯塔兒派出了他他的最初夥伴月桂葉月桂葉使出了藤鞭，火炎鼠使出了火花火花，這招效果拔群月桂葉被幹掉了，火炎鼠獲得了很多經驗，克麗斯塔兒右派出的他第一隻捕捉的寶可夢小拉達，被阿金使用尼多利諾第二段踢輕鬆打敗，只能去寶可夢中心恢復寶可夢的血量，寶可夢中心能回覆寶可夢的血量，而商店可以購買很多裝備，在寶可夢對決中敗者需要給贏者錢。
在贏得勝利之後阿金和小銀慢慢來，到了檜皮鎮，這裡是蟲系道館的所在地，阿金走了進去，靠著火炎鼠輕鬆得到了第二枚徽章，而在這裡，有一處名為呆呆獸之井的地方，阿金和小銀走了進去，看見了火箭隊正在拔呆呆獸的尾巴，小銀和阿金走了過去拍了拍藝人的肩膀，那人是火箭隊的一名重要幹部蘭斯他一眼就看見了少主小銀。阿金和小銀說明了來意，他們立刻放下了手裡的呆呆獸，把他倆接到了總部。這一路上，他們倆手裡的藍鱷和火球鼠已達到了30級，因為追兵實在是太多了。藍鱷在30級的時候已經進化成了大力鱷。而在基地小銀和阿金正在拿著已經28級的鬼斯通和31級的尼多力諾交換鬼斯透過交換進化成了耿鬼，阿姨也給了阿金一顆月亮石，阿金把月亮石給了尼多力諾尼多力諾成功進化成了尼多王。他們倆也正式成為了火箭隊的一員，小銀也在火箭隊公司拿到了他父親板木的王牌寶可夢鑽角犀獸，耳目已經失蹤很久了，在關東地區被赤紅打敗後失蹤了，所以這時，火箭隊的頭目就是他的兒子小銀。
在看見小銀以及三隻寶可夢的時候，阿金也走了出去準備碰碰運氣收服一隻寶可夢這一路上想要抓捕他的人不下其數，但都沒有成功的在這些人裡。阿金金的火炎鼠成功升到了36即進化成了火暴獸。又擊敗了很多人，這是阿金的火暴獸已經41級了，而尼多王經過阿金的訓練也已經變成40級的寶可夢了，就在阿金準備回去的時候，突然一聲大喊吸引的他，他看見一個富家子弟正驅逐著一隻沙基拉斯，因為他敗給了他的水箭龜，於是這個富家子弟覺得半沙基拉斯沒用，於是就趕他走，阿金走了過去指責富家子弟不該驅逐每一個寶可夢沒有廢物的寶可夢，只有不會培養寶可夢的訓練家，富家子弟哪受過這等氣，直接派出水箭龜進行攻擊這隻水箭龜50多級，阿金很難對付，這時沙基拉斯進化了變成了班吉拉斯直接擊敗了水箭龜，阿金順勢派出火暴獸，消滅了很其他寶可夢，富家子弟落荒而逃，阿金也服了班基拉斯。就這樣，阿金帶著他的三隻寶可夢在訓練了很長時間後回到了基地，今天阿金的寶可夢提升非常大。不僅火爆獸變成了60級還學會了噴射火焰，還獲得了一隻55級的班吉拉斯，還把尼多王練到了59級。
再回到基地後，火箭隊與小瑩商量著什麼，阿金也加入了進去。原來，火箭隊準備幹一票大的。